通过三代试管婴儿移植后生出畸形有缺陷的孩子的几率还是比较低的。因为三代试管婴儿技术是在一、三代试管婴儿技术的基础上增加了染色体查的功能，能从囊胚中检测遗传物质，并且排查出90%左右的畸形以及遗传疾病，所以三代试管婴儿生育出患畸形的概率还是比较低的，因此三代试管婴儿家庭应该放松心态，不要太过担心，紧张的情绪是不利于三代试管婴儿的移植的。当然，在三代试管婴儿移植期间比较好是调整为好的生活习惯，少熬夜抽烟等，避免宝宝发育不正常。

目前三代试管婴儿的技术已经日益成熟，三代试管婴儿宝宝畸形率与普通怀孕的畸形率相差无几。此外，由于三代试管婴儿技术的发展，对于有严重遗传病缺陷的家庭，帮助他们将胚胎畸形率大大降低，在满足这些家庭生育需求的基础上，可保证三代试管婴儿的健康率。

所以，对于有遗传病缺陷或反复流产、染色体异常的情况，即使能够自然受孕，仍然建议做三代试管婴儿。因为通过三代试管婴儿技术的应用，对胚胎染色体进行查，保留染色体正常的胚胎，可以使助孕畸形率大大降低。